长三角地区有24个国家级自然保护区
长三角地区包括苏浙沪皖三省一市，是我国经济最发达、人口最稠密的地区。长三角地区十分重视自然保护区的建设工作，已建有100多个各级自然保护区（包括省级、市级和县级），其中有盐城湿地珍禽国家级自然保护区、崇明东滩鸟类国家级自然保护区、安徽升金湖国家级自然保护区、浙江天目山国家级自然保护区等24个国家级自然保护区（截止2021年底）。
长三角地区的国家级自然保护区中位于江苏省的有3个，安徽省有8个，浙江省有11个，上海市有2个。盐城湿地珍禽国家级自然保护区、大丰麋鹿国家级自然保护区、天目山国家级自然保护区、南麂列岛国家级自然保护区等自然保护区是联合国教科文组织的“世界生物圈保护区网络”成员，大丰麋鹿国家级自然保护区、盐城湿地珍禽国家级自然保护区、崇明东滩鸟类国家级自然保护区、安徽升金湖国家级自然保护区等入选《国际重要湿地名录》。
江苏省有3个国家级自然保护区
江苏省现有盐城湿地珍禽国家级自然保护区、大丰麋鹿国家级自然保护区和洪泽湖湿地国家级自然保护区等三个国家级自然保护区（截止2021年末），盐城湿地珍禽国家级自然保护区和大丰麋鹿国家级自然保护区均位于盐城市，洪泽湖湿地国家级自然保护区位于宿迁市。
在盐城湿地珍禽国家级自然保护区越冬的丹顶鹤
江苏盐城湿地珍禽国家级自然保护区地跨盐城市大丰区、射阳县、东台市、滨海县、响水县，面积24.7万公顷，是一个以丹顶鹤等珍禽及沿海滩涂湿地生态系统为保护对象的自然保护区，该保护区生物多样性丰富，有各类动物1800余种（其中鸟类420多种），高等植物690多种，有我国一级保护动物38种（其中鸟类28种），有“国家重要湿地基因库”之称。盐城湿地珍禽自然保护区内有大面积的滩涂湿地，是历史上黄河夺淮（河）期间大量倾注入海的泥沙、长江等河流下泄的泥沙及海底的部分泥沙，在潮流等海洋动力作用下淤积而成，且每年滩涂面积都有增长；保护区独特的地理位置、优良的环境和丰富的食物吸引了大量的候鸟来此越冬、停留歇息，由于该保护区地处江苏沿海中部，是全球9大鸟类迁徙路线之一的东亚——澳大利亚鸟类迁徙路线上重要的栖息地，每年有2000多万只候鸟停留歇息，有丹顶鹤、灰鹤、白鹤、东方白鹳、大雁、野鸭、苍鹭等几百万只候鸟在此越冬，其中在此越冬的丹顶鹤每年在400~600只，是全球最大的丹顶鹤越冬地。盐城湿地珍禽国家级自然保护区的前身是成立于1983年的江苏省盐城地区省级沿海滩涂珍禽自然保护区，1992年晋升为国家级自然保护区，1992年被纳入联合国教科组织的“世界生物圈保护区网络”，2002年入选《国家重要湿地名录》，2007年保护区范围有所调整并更名为江苏盐城湿地珍禽国家级自然保护区。
大丰麋鹿国家级自然保护区内的麋鹿
大丰麋鹿国家级自然保护区位于盐城市大丰区境内，总面积78000公顷，是一个以麋鹿、丹顶鹤及湿地生态系统为保护对象的自然保护区；大丰麋鹿国家级自然保护区地处江苏中部黄海之滨，区内有大面积的沼泽地、林地、沿海滩涂地和自然水域，有麋鹿、丹顶鹤、白鹤、白尾海雕等珍稀动物在此栖息，拥有目前世界最大的野生麋鹿种群，是世界最大的麋鹿基因库；1986年原国家林业部和江苏省政府联合在大丰沿海创建麋鹿保护区，从英国运回42头麋鹿，经过30多年的野外驯化，如今保护区内的麋鹿种群数量达到8200余只，占世界麋鹿种群总数的70%以上。麋鹿是鹿科麋鹿属的唯一种，别名四不像，曾广布于东亚各地，19世纪末在我国灭绝，20世纪80年代从英国返回中国获得新生。大丰麋鹿自然保护区成立于1986年，1995年加入联合国教科文组织的“世界生物圈保护区网络”，1997年晋升为国家级自然保护区，2002年入选《国际重要湿地名录》，2003年被湿地国际列入“东亚—澳大利亚鸟类保护网络”成员，2003年被原国家林业部评为“全国示范保护区”。
安徽省有8个国家级自然保护区
安徽省现有安徽清凉峰国家级自然保护区、安徽扬子鳄国家级自然保护区等8个国家级自然保护区（截止2021年末），安徽扬子鳄国家级自然保护区和安徽清凉峰国家级自然保护区在宣州市，安徽金寨天马国家级自然保护区在六安市，安徽铜陵淡水豚国家级自然保护区在铜陵市，安徽古井园国家级自然保护区和安徽鹞落坪国家级自然保护区在安庆市，安徽升金湖国家级自然保护区和安徽牯牛降国家级自然保护区位于池州市。
中国鹤湖——升金湖
东方白鹳有“鸟中国宝”之称
安徽升金湖国家级自然保护区位于东至县和池州贵池区境内，以升金湖为主体，面积33400公顷，是一个以东方白鹳等珍稀鸟类及湿地生态系统为保护对象的自然保护区，属野生动物类型自然保护区；升金湖是一个位于安庆市东至县长江北岸的面积130多平方千米的通江湖泊，水生生物资源极为丰富，优良的环境和丰富的食物吸引着每年十多万只的东方白鹳、白头鹤、黑鹤、灰鹤、白琵鹭、鸿雁、豆雁等候鸟来此越冬，其中每年来此越冬的白头鹤约400~600只，东方白鹳1000多只，白琵鹭约3000只左右，小天鹅1万只以上，鸿雁4万只以上，是我国主要的鹤类越冬地之一，有“中国鹤湖”之称；2023—2024年越冬季来升金湖越冬的东方白鹳创历史新高达1700只，成为我国第二大东方白鹳越冬地（仅次于江西鄱阳湖）。东方白鹳是鹳形目鹳科鹳属的一种大型涉禽（与白颈鹳、黑鹳、白鹳等同属），身体羽毛主要为纯白色，眼周裸区、脚、趾、嘴为红色，广泛分布在我国除西北、西藏、广东、广西外的各地，在北方繁殖，在长江中下游的湿地湖泊越冬，东方白鹳现全球仅存3000只左右，为我国一级重点保护野生动物，被世界自然保护联盟列为濒危等级。安徽升金湖自然保护区（省级）成立于1986年，1988年被编入《亚洲重要湿地名录》，1997年晋升为国家级自然保护区，2015年入选《国际重要湿地名录》。
位于安徽金寨县的金寨天马国家级自然保护区
仅生活在大别山区的大别山五针松是我国一级保护野生植物
仅存于大别山区的安徽麝是我国一级保护野生动物
金寨天马国家级自然保护区位于安徽省金寨县境内，面积28914公顷，以亚热带常绿落叶阔叶混交林及安徽麝、大别山五针松等珍稀动植物为保护对象，属森林生态类型自然保护区，是安徽省乃至华东地区规模最大、森林覆盖率最高、生物多样性最丰富的自然保护区。金寨天马国家级自然保护区地处皖西大别山腹地，区内群峰起伏，最高峰天堂寨海拔1729米（为大别山第二高峰）；这里地理条件复杂多种，是华东、华北、华中三大植物区系交汇点，我国第三纪天然植物的“避难所”，存有大面积的原始次生林，被称为“华东最后一片原始森林”；保护区内有高等植物1800多种，脊椎动物近300种，有银缕梅、金钱松、大别山五针松、连香树、香果树、白冠长尾雉、安徽麝、金钱豹、小灵猫、大鲵、雀鹰等珍稀动植物。安徽麝是偶蹄目麝属的一种（安徽麝与原麝、黑麝、林麝、喜马拉雅麝等同属），为大别山特有种，仅存于大别山深山区，为我国一级保护野生动物，被世界自然保护联盟列为濒危物种，目前野生种群数量不足600只。大别山五针松为松科松属的一种常绿乔木，别名安徽五针松，是中国特有植物，仅存于大别山海拔900～1400米的山坡地带，是松科中最古老、最原始的一族，为我国一级保护野生植物，被世界自然保护联盟列为易危物种。金寨天马自然保护区的前身是成立于1982年的金寨天堂寨自然保护区（省级）和成立于1990年的金寨马鬃岭自然保护区（省级），1998年金寨天堂寨自然保护区和马鬃自然保护区合并而成为金寨天马国家级自然保护区。
安徽宣城扬子鳄国家级自然保护区是一个以保护扬子鳄及其生活环境的自然保护区
安徽宣城扬子鳄国家级自然保护区位于安徽宣城市宣州区、泾县、郎溪县、广德市及芜湖市南陵区等县市区，总面积1.86万平方千米（核心区面积5188平方千米），是一个以保护扬子鳄及其生活环境的国家级自然保护区；保护区地处长江下游平原丘陵水网区，为皖南山区向长江下游沿岸平原过渡地带，为亚热带季风气候，冬温夏热，降水丰沛，河流湖泊密布，动植物资源丰富，有扬子鳄、云豹、黑麂、梅花鹿、鸳鸯、穿山甲、白鹇等珍稀动物，是我国目前唯一的野生扬子鳄栖息地。扬子鳄是爬行纲鳄目短吻鳄科短吻鳄属的一种中小型鳄类，体型类似蜥蜴，成体体长1.5～2.1米，体重36～45千克，别名土龙、猪婆龙，仅存于皖南长江下游沿岸地区，为我国一级保护野生动物，被世界自然保护联盟评为极危物种，目前全球野生种群不足200只。安徽宣城扬子鳄自然保护区始建于1979年，1982年成为省级自然保护区，1986年晋升为国家级自然保护区，直属安徽省林业厅，为全球最大的扬子鳄种群繁育基地，人工繁殖扬子鳄已达1万余只。
浙江省有11个国家级自然保护区
浙江省有浙江大盘山国家级自然保护区、浙江南麂列岛国家级自然保护区等11个国家级自然保护区，他们分布于浙江7个地级市，浙江大盘山国家级自然保护区在金华市，浙江南麂列岛国家级自然保护区和浙江乌岩岭国家级自然保护区在温州市，浙江象山韭山列岛海洋生态国家级自然保护区在宁波市，浙江古田山国家级自然保护区在衢州市，浙江凤阳山—百山祖国家级自然保护区在丽水市，浙江安吉小鲵国家级自然保护区、浙江长兴地质遗迹国家级自然保护区和浙江九龙山国家级自然保护区在湖州市，浙江天目山国家级自然保护区和浙江清凉峰国家级自然保护区在杭州市。
百山祖冷杉有“植物大熊猫”之称
凤阳山—百山祖国家级自然保护区位于丽水市庆元县和龙泉市境内，包括凤阳山片区和百山祖片区两部分组成，面积2.6万公顷，是以百山祖冷杉等珍稀动植物及森林生态系统为保护对象的自然保护区，属森林生态类型自然保护区。位于龙泉市南部的凤阳山是武夷山系的分支，最高峰黄茅尖是浙江第一高峰（海拔1929米），这里素有“华东古老动植物的摇篮”之称，亚热带常绿阔叶森林中有白豆杉、香果树、华东黄杉、福建柏、黑麂、猕猴、大灵猫等珍稀动植物。北距凤阳山20千米隔谷相望的百山祖位于丽水市庆元县百山祖乡，也是武夷山系的分支，是浙江第二高山（最高峰海拔1857米），是江浙一带植物资源极为丰富的地区，有种子植物2000余种，蕨类植物230多种，苔藓植物300多种，真菌资源250多种，是世界级珍稀濒危植物——百山祖冷杉的生长地。百祖山冷杉是松科冷杉属的一种乔木，高约11米，第四纪冰川时期的孑遗植物，1960年代在百山祖南坡海拔1700处发现时仅存有五株，1987年被国际物种保护委员会列为全球12种最濒危植物之一，为我国一级重点保护野生植物，有“植物大熊猫”之称。凤阳山—百山祖国家级自然保护区的前身是成立于1975年的凤阳山自然保护区（省级）和1985年成立的百山祖自然保护区（省级），1992年凤阳山自然保护区与百山祖自然保护区合并为凤阳山—百山祖国家级自然保护区。
位于浙江西北部的天目山国家级自然保护区是“世界生物圈保护区网络”成员
天目山国家级自然保护区位于杭州市临安区天目山镇，面积4284公顷，是一个以银杏、连香树、金钱松、鹅掌楸、天目铁树等珍稀植物及森林生态系统为保护对象的自然保护区，是浙江省第一个国家级自然保护区；保护区主体是天目山最高峰仙人顶（海拔1506米）一带，这里有茂密的亚热带森林，有常绿阔叶林带、低山常绿落叶阔叶林带、中山落叶阔叶林带、山顶部灌丛矮林带四个垂直自然带，动植物资源极为丰富，有银杏、连香树、天目铁木、鹅掌楸、金钱松、香果树、天目木姜子、浙江楠、黑麂、梅花鹿、黑冠鹃隼、蛇雕、中华虎凤蝶等珍稀动植物。连香树为木兰纲连香树科连香树属的一种落叶乔木，高10~20米，分布于陕西、河南、甘肃、安徽、浙江、江西、湖北、四川等地，为第三纪古热带孑遗植物，是较古老原始的木本植物，雌雄异株，结实较少，天然更新困难，已濒临灭绝状态，被列为我国二级保护野生植物。鹅掌楸别名马褂木、宝剑木，是木兰纲木木兰科鹅掌楸属的一种落叶大乔木，叶形奇特，形似马褂，主要分布于越南北部和我国长江流域南部亚热带的低山地区，为我国二级保护野生植物。天目铁木是木兰纲桦木目铁木属的一种落叶乔木，高18米，仅分布于浙江天目山，1927年被我国植物学家发现并命名，现存有5株原生古树，为我国独有的稀有植物，被世界自然保护联盟列为极危物种。天目山国家级自然保护区的前身是成立于1975年的临安西天目山自然保护区（省级），1986年晋升为国家级自然保护区，1996年入选联合国教科文组织的“世界生物圈保护区网络”。
白颈长尾雉是我国一级保护野生动物
古田山国家级自然保护区中的一只黑麂
古田山国家级自然保护区位于浙江衢州市开化县境内，以古田山为核心，面积8108公顷，以白颈长尾雉、黑麂、南方红豆杉等珍稀动植物为保护对象的自然保护区，属野生动物类型自然保护区；位于浙西北开化县苏庄镇的古田山是一座海拔961米的低山，山势险峻，古木参天，生长着茂密的亚热带常绿天然次生林，林中有白颈长尾雉、黑麂、云豹、小灵猫、猕猴、白娴、金裳凤蝶、香果树、福建石楠等珍稀动植物。白颈长尾雉是雉科长尾雉属的一种大型鸡类（与白冠长尾雉、黑颈长尾雉、黑长尾雉、铜长尾雉同属），别名横纹背鸡、花山鸡，中国特有珍稀鸟类，主要分布于我国东南部低山丘陵区，为我国一级保护野生动物。黑麂是鹿科麂属的一种草食动物，别名青麂、蓬头鹿，头部有簇状金黄或棕黄色的长毛，雄性有角雌性无角，四肢黑褐色，主要分布在我国浙江西部、安徽南部、江西东北内部及福建北部的常绿阔叶林中，现为我国一级保护野生动物。古田山自然保护区（省级）成立于1975年，2001年晋升为国家级自然保护区。
上海市有2个国家级自然保护区
上海市现有崇明东滩鸟类国家级自然保护区和上海九段沙湿地国家级自然保护区两个国家级自然保护区。
位于上海崇明岛东端的崇明东滩鸟类国家级自然保护区
上海崇明东滩鸟类国家级自然保护区位于上海市崇明区境内，面积3.26万公顷，是一个以湿地生态系统和珍稀鸟类为保护对象的自然保护区，是我国规模最大、最为典型的河口型潮汐滩涂湿地之一；该保护区地处我国长江入海口崇明岛东端，由团结沙外滩、东旺沙外滩、北八斗外滩、潮间带滩涂湿地和河口水域组成，是亚太地区春秋季候鸟迁徙的重要停靠地和驿站，每年来此湿地停靠歇息的鸟类有上百万只；每年来保护区停留造访的鸟类有小天鹅、东方白鹳、黑鹳、白尾海雕、白头鹤、灰鹤、黑脸琵琶等300多种，其中来此越冬的小天鹅有3000~3500只，是我国仅次于鄱阳湖的第二大小天鹅越冬地。小天鹅是雁形目鸭科天鹅属鸟类，别名短嘴天鹅、啸声天鹅，成鸟遍体雪白，仅头顶为淡棕黄色，体型较大天鹅小，繁殖于亚欧大陆和北美洲极北部，我国的越冬地主要在长江流域及东南沿海，为我国二级保护野生动物。崇明东滩鸟类国家级自然保护区设立于1998年，2002年入选《国际重要湿地名录》，2005年晋升为国家级自然保护区。
